Les anticorps sont incroyablement utiles. Beaucoup de médicaments récemment développés reposent sur des anticorps qui se lient et bloquent l’activité de protéines spécifiques. Ils sont aussi d’excellents outils de recherche, nous permettant d’identifier des protéines à l’intérieur des cellules, de purifier à la fois des protéines et des cellules, etc. Les anticorps thérapeutiques ont fourni nos premières défenses contre les virus émergents tels que Ebola et le SARS-CoV-2. Cependant, fabriquer des anticorps peut être une tâche sérieuse, car cela implique de faire produire des anticorps par des animaux. Vous devez purifier la protéine à laquelle vous voulez que les anticorps adhèrent, l’injecter dans un animal et obtenir l’animal à produire des anticorps dans le cadre d’une réponse immunitaire. Ensuite, vous purifiez soit les anticorps, soit les cellules qui les produisent. C’est long, cela ne fonctionne pas toujours et parfois produit des anticorps avec des propriétés non recherchées. Mais grâce aux développements dans les prédictions de protéines basées sur l’IA, tout ce tracas pourrait devenir inutile. Un modèle de diffusion récemment développé pour les structures protéiques a été adapté à la production d’anticorps et a conçu avec succès des anticorps contre les protéines du virus de la grippe. Les humains (et de nombreux autres mammifères) produisent des anticorps qui sont des complexes de quatre protéines composés de deux protéines lourdes et deux légères. Les protéines lourdes et légères ont des régions constantes, identiques ou similaires parmi tous les anticorps produits. Elles ont également toutes deux une région variable, unique à chaque anticorps. C’est la région variable qui est responsable de la reconnaissance des protéines dans les virus et autres agents pathogènes. Certains autres mammifères, comme les chameaux, sautent les protéines légères et ont des anticorps qui sont simplement une paire de protéines lourdes (qui reconnaissent encore les agents pathogènes via les régions variables des protéines lourdes). Le corps ne sait pas quelles protéines il devra éventuellement reconnaître. Donc, il se contente de produire beaucoup de cellules produisant des anticorps, chacune ayant une combinaison unique de régions variables lourdes et légères. Lorsque l’une de ces cellules rencontre la protéine que ses anticorps reconnaissent, elle commence à se diviser et produit beaucoup de l’anticorps nécessaire. Il faut du temps à ces cellules pour mûrir et du temps supplémentaire pour les purifier. De plus, il n’y a aucune garantie que la combinaison spécifique de régions variables sera la meilleure pour la reconnaissance d’une protéine.
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